Gustavo Santaolalla. Premio Guadalajara 2008

El Jurado internacional es el encargado de otorgar los premios Mayahuel entre las películas participantes de las secciones oficiales.

Además de estos premios, el Festival cuenta con una serie de Premios no Oficiales, otorgados por votación popular (Premio del Público), jurados especialmente constituidos (Premio Mezcal) o por instituciones internacionales (Premio FIPRESCI o Premio FEISAL)

Cada año el Festival también rinde homenaje a una figura del cine nacional con un ciclo de su obra y una ceremonia en la que se le entrega el Mayahuel de Plata.

En 2007 se entregó por primera vez el Premio Guadalajara en homenaje a una figura iberoamericana que ha tenido impacto en el cine internacional. El primer galardonado fue el director Guillermo del Toro.

En 2008, además de estos premios y homenajes, el Festival programó un tributo especial al actor Germán Valdés, famoso por su apodo popular: Tin Tán así como un homenaje a los directores argentinos Fernando Birri y Fernando Solanas y a la productora Lita Stantic.